Historia
La última misión de Old Snake por cuatro zonas de guerra para dar caza a Liquid Ocelot y desmantelar el sistema de IA de guerra de los Patriots antes de que su cuerpo lo abandone para siempre.
Una economía de guerra construida a base de nanomáquinas
Para 2014, el sistema de IA de los Patriots ha convertido la guerra moderna en una economía autosuficiente. Las compañías militares privadas (PMC) libran guerras de baja intensidad sin fin por todo el mundo, con sus soldados armados y dirigidos por SOP, una red de campo de batalla que lee las nanomáquinas de cada combatiente para gestionar el estrés, la puntería y el reconocimiento amigo-enemigo en tiempo real. La guerra misma se ha convertido en una industria con su propia cadena de suministro, y Liquid Ocelot —el cuerpo de Revolver Ocelot, secuestrado por un brazo injertado que porta la mente, y más tarde la voluntad, de Liquid Snake— está maniobrando para hacerse con el control de SOP.
La última misión de Old Snake
Solid Snake, modificado genéticamente para envejecer unas cuatro veces más rápido de lo normal, es ya un anciano moribundo de poco más de cuarenta años, con el cuerpo fallándole por una cepa mutada de FOXDIE que lo está matando a él y a cualquiera que se infecte a su lado. Roy Campbell y Naomi Hunter le piden un último favor: dar caza a Liquid Ocelot antes de que pueda volver SOP contra el mundo entero. Guiado por Otacon y Naomi por códec, y con la ayuda del traficante de armas del mercado negro Drebin (cuyos robots de apoyo Mk. II/III rastrean a distancia el Traje Sigiloso y el OctoCamo de Snake), Snake sigue el rastro de Liquid por una zona de guerra en Oriente Medio, donde ve por primera vez a su objetivo y a la Rat Patrol 01, una milicia de resistencia liderada por una vieja amiga bajo un rostro nuevo.
Sudamérica y el Cuerpo B&B
En Sudamérica, Snake conoce a Big Mama, una revolucionaria veterana que resulta ser un rostro perdido de su propio pasado, y choca de frente con el Cuerpo Beauty and the Beast: cuatro soldados femeninas, cada una tan destrozada psicológicamente por la guerra que su exotraje de combate se ha fusionado de forma permanente a su cuerpo. Laughing Octopus es la primera en caer. Más adelante, Snake encuentra a Naomi capturada por Vamp, el asesino casi indestructible del incidente del Big Shell, ahora al servicio de Liquid.
Europa y la verdad sobre EVA
En Europa del Este, Snake colabora con la resistencia local para rastrear la estructura de mando de SOP a través de una ciudad ocupada por las PMC, y después acompaña a Big Mama en una persecución en moto contra Raging Raven y su bandada de Ravens teledirigidos. Es aquí donde la verdadera identidad de Big Mama sale a la luz: es EVA, la agente doble que en su día ayudó a Naked Snake y que más tarde crio a Liquid y a Solidus como si fueran suyos, guardando secretos sobre los Patriots, el Legado de los Filósofos y el propio origen de Snake que se remontan hasta la Guerra Fría.
Shadow Moses, otra vez
El acercamiento final de Snake al núcleo de IA de los Patriots pasa directamente por la isla Shadow Moses, la instalación de eliminación de armas nucleares donde tuvo lugar el incidente original de Metal Gear una década antes. Tras una travesía por la nieve y un combate contra Crying Wolf, Snake se reencuentra con Raiden, ya poco más que un cíborg envuelto alrededor de un cuerpo moribundo, y juntos contienen oleadas de Gekko programados para autodestruirse mientras Naomi inyecta a Snake un suero que por fin acaba con Vamp de forma definitiva. Liquid Ocelot llega pilotando el Metal Gear REX original, y Snake —con la ayuda del Metal Gear MK. III, reconstruido por Otacon— lo enfrenta hasta dejarlo en tablas.
Viejo Sol
El rastro termina a bordo del Outer Haven, el buque insignia de Liquid: un acorazado no tripulado diseñado para difundir una versión corrupta y armada de SOP a todas las PMC del planeta, tomando de golpe el control de las nanomáquinas de cada soldado. Snake se abre paso a través del último miembro del Cuerpo B&B, Screaming Mantis, que controla el cuerpo de Meryl, y finalmente acorrala a Liquid Ocelot en el núcleo del barco. Ahí sale a la luz toda la verdad: Ocelot llevaba años interpretando el papel de Liquid y enfrentando a las propias IA de los Patriots entre sí, usando autohipnosis para engañar incluso al detector de mentiras basado en nanomáquinas integrado en SOP, todo para arrastrar a los Patriots —y la economía de guerra que construyeron— con él en su caída. Lo que queda es una última pelea a puñetazos, sin palabras, entre dos viejos soldados, resuelta como su historia siempre debió resolverse, antes de que Snake se marche a pasar el tiempo que le quede a su manera.