Historia
La cronología, el origen mitocondrial, los personajes principales y la investigación del M.I.S.T.
El Incidente de Manhattan (1997) y el origen de Eve
En la víspera de Navidad de 1997 en Nueva York, durante una función de ópera en el Carnegie Hall, la actriz Melissa Pearce sufrió una violenta mutación celular cuando sus mitocondrias despertaron, convirtiéndose en el ente biológico conocido como Eve. El despertar mitocondrial provocó la combustión espontánea de cientos de espectadores en el teatro.
La detective novata de la policía de Nueva York (NYPD), Aya Brea, descubrió que sus propias mitocondrias también habían evolucionado, otorgándole habilidades biológicas sobrehumanas (Parasite Energy) y total inmunidad a los poderes de Eve. Tras una semana de pesadilla por Central Park, el Museo Americano de Historia Natural y el río Hudson, Aya destruyó a Eve y al Ser Supremo gestado por ella, salvando a la humanidad de la extinción.
Fundación del M.I.S.T. y el caso de la Torre Akropolis (2000)
A raíz de la catástrofe de Nueva York, el gobierno de los Estados Unidos y el FBI formaron en secreto el M.I.S.T. (Mitochondrial Investigation and Suppression Team), una división táctica de élite creada específicamente para investigar y erradicar cualquier brote de Criaturas Neo-Mitocondriales (NMC). Aya renunció a la policía para unirse al M.I.S.T. como agente de campo en Los Ángeles, bajo el mando del veterano Rupert Broderick y asistida por el técnico armamentista Pierce Carradine y la armera Jodie Bouquet.
El 4 de septiembre de 2000, una célula de NMCs asalta la lujosa Torre Akropolis en Los Ángeles, masacrando al equipo S.W.A.T. local. Durante la incursión, Aya descubre que estas criaturas no son mutaciones naturales, sino especímenes creados artificialmente (ANMC) controlados por un misterioso cíborg asesino conocido como No.9.
El misterio de Dryfield y el encuentro con Kyle Madigan
Las pistas encontradas en Akropolis conducen a Aya hacia Dryfield, un aislado pueblo minero en pleno desierto de Mojave, Nevada. Al llegar, encuentra el pueblo totalmente devastado e infestado por nuevas cepas de criaturas.
En Dryfield, Aya establece contacto con el único superviviente local, el armero veterano Gary Douglas (y su leal perro Flint), y con Kyle Madigan, un enigmático investigador privado que afirma estar tras la pista de una instalación científica clandestina. Juntos logran repeler a los monstruos y neutralizar la amenaza de No.9, descubriendo una entrada secreta a través de las viejas minas del desierto.
The Shelter, Neo Ark y el Proyecto Neo-Mitocondria
Bajo el desierto de Mojave se oculta The Shelter, un complejo militar y de investigación de última tecnología. Allí, una facción científica clandestina liderada en secreto por altos mandos operaba el Proyecto Neo-Mitocondria con el objetivo de forzar la evolución de la raza humana hacia una nueva especie.
En el corazón del complejo se halla Neo Ark, una colosal biosfera artificial subterránea que recrea ecosistemas tropicales y templados para cultivar y probar las ANMCs. Aya descubre que la fuente genética utilizada para crear a estas criaturas proviene de sus propias células clonadas, y que el proyecto culminó en la creación de Eve, una niña clonada que alberga la conciencia y el poder mitocondrial absoluto.
La confrontación con el Ultimate ANMC y el destino de Eve
Con el ejército estadounidense interviniendo en la superficie y los soldados bio-mecánicos Golems desplegados para eliminar cualquier rastro, Aya desciende a las profundidades de la planta de energía. Tras rescatar a sus aliados y desmantelar los generadores de la biosfera, Aya destruye al monstruoso Ultimate ANMC en la cámara de incubación.
Desesperada y manipulada por los restos mitocondriales, la joven Eve muta en una forma alada colosal. Tras una cruenta batalla final en el puente de mando, Aya logra purificar el cuerpo de Eve sin arrebatarle la vida. Con la caída del Shelter y el encubrimiento oficial de los hechos, Aya adopta a la pequeña Eve como su hermana menor, comenzando una nueva vida en paz lejos de las pesadillas genéticas.