Historia
La búsqueda de Claire y Chris Redfield por la verdad detrás de la dinastía Ashford, Albert Wesker y el Virus T-Veronica.
Infiltración en París y Asedio a la Isla Rockfort
Diciembre de 1998, tres meses después de la aniquilación de Raccoon City. Claire Redfield continúa la búsqueda de su hermano desaparecido, Chris. Tras infiltrarse en la sede europea de Umbrella en París, es capturada por las fuerzas de seguridad y trasladada como prisionera a la remota Isla Rockfort, una base militar y penal privada bajo el mando de la familia Ashford.
Poco después de su encierro, la isla es objeto de un violento bombardeo aéreo perpetrado por Albert Wesker y su unidad especial H.C.F., cuyo objetivo es sustraer muestras del Virus T-Veronica. El ataque destruye las instalaciones y libera el Virus-T entre guardias y reclusos. Claire es liberada de su celda por el guardia malherido Rodrigo Juan Raval, quien le entrega su mechero. Al explorar las ruinas de la prisión, Claire se alía con otro joven superviviente, Steve Burnside, y ambos se ven acosados por el desquiciado comandante de la base, Alfred Ashford.
El Secreto de los Ashford y la Huida a la Antártida
Claire y Steve descubren que Alfred y su ausente hermana gemela, Alexia Ashford, son los herederos de uno de los tres fundadores originales de Umbrella. Al explorar la residencia privada y la réplica de la Mansión Spencer construida en la isla, Claire descubre una verdad perturbadora: Alexia no está presente físicamente; Alfred sufre un severo trastorno de identidad disociativo, disfrazándose con la ropa de su hermana y modulando su voz para mantener la ilusión de su presencia.
Claire y Steve logran activar un avión de transporte de carga en el aeropuerto militar para escapar de la isla en llamas. Sin embargo, Alfred toma el control remoto de la aeronave mediante piloto automático, desviándola hacia la Base de Investigación de Umbrella en la Antártida y liberando a una B.O.W. Tyrant (T-078) a bordo. Claire consigue expulsar al Tyrant de la bodega arrojándole un palé de carga con el sistema de expulsión hidráulico antes del forzoso aterrizaje en la nieve antártica.
El Despertar de Alexia y la Llegada de Chris
En la base polar, Claire y Steve se enfrentan al horroroso legado de los gemelos: hace quince años, Alfred y Alexia experimentaron con su propio padre, Alexander Ashford, inyectándole el virus prototipo y transformándolo en el monstruo encadenado Nosferatu. Claire derrota a Nosferatu en el helipuerto polar, mientras que Steve abate a tiros a Alfred al intentar atacarlos. Mortalmente herido, Alfred se arrastra hasta la cámara criogénica secreta y presencia en sus últimos segundos el despertar de la verdadera Alexia Ashford, quien ha culminado su sueño criogénico de 15 años perfectamente asimilada con el Virus T-Veronica.
Simultáneamente, Chris Redfield llega a la Isla Rockfort tras recibir el mensaje de auxilio de Leon. En la isla devastada, Chris se reencuentra con Rodrigo (quien le entrega el mechero de Claire antes de morir por el ataque del gusano Gulp Worm) y tiene un brutal cara a cara con Albert Wesker, vivo y dotado de velocidad y fuerza sobrehumanas gracias a un virus prototipo. Al enterarse de que Claire está en la Antártida, Chris aborda un caza Harrier y vuela rumbo al polo sur.
El Sacrificio de Steve, el Fin de Alexia y la Huida
En la base antártica, Alexia neutraliza y captura a Steve, inoculándole una cepa salvaje del T-Veronica que lo transforma en una enorme criatura mutante con hacha. Cuando la bestia arrincona a Claire, Alexia interviene con sus tentáculos gigantes; Steve recupera la consciencia por amor a Claire y corta los tentáculos para protegerla, resultando herido de muerte. En brazos de Claire, Steve revierte a su forma humana, le confiesa su amor ("Te amo, Claire...") y fallece en una de las escenas más emotivas de la saga.
Chris rescata a Claire y ambos activan el sistema de autodestrucción de la base. Alexia se interpone mutando en una gigantesca reina insectoide voladora, pero Chris la destruye definitivamente empleando el arma de energía Linear Launcher. Wesker aprovecha el caos para recuperar el cadáver de Steve (que aún contiene el Virus T-Veronica puro en su sangre) y tras un breve enfrentamiento con Chris, huye jurando venganza. Chris y Claire abordan el avión Harrier y escapan juntos mientras la base polar se desintegra en una explosión masiva.